1955
Megalakult a Cukor Utcai Gyakorló Általános Iskola és Gimnázium, a Fővárosi Tanács határozata értelmében, a régi Budapesti Pedagógiai Főiskola épületében. Húsz osztállyal (négy alsó, nyolc felső tagozatossal és nyolc gimnáziumival) indult a képzés.
1956
Ebben az évben tett érettségi vizsgát az első két osztály. Az első igazgató, Dr. Fischer Vilmos állt a közel negyven tagú tanári kar élén. Az intézmény gyakorlóiskolának indult, ami speciális feltételeket igényelt. Alsó tagozaton területi beiskolázási rendszerben működött, felsőbe és a gimnáziumba egész Budapestről pályázhattak a diákok, vagyis kezdettől fogva tehetséges tanulókkal dolgozhatott az iskola. A szerencsés képzési forma gyorsan látványos eredményeket hozott.
1957
Felvette az iskola Apáczai Csere János nevét. Négy újabb osztállyal bővült a létszám.
1958
A tanárképzéssel is foglalkozó tudományegyetem lett az új fenntartó, ennek megfelelően ELTE Apáczai Csere János Gyakorlóiskola a hivatalos megnevezés. Ekkor került az Apáczai élére dr. Temesi Alfréd, akinek talán a legtöbbet köszönheti az iskola. Olyan tanárokat alkalmazott, akik a következő évtizedek során meghatározó alakjai lettek az iskolának.
1961
1961 januárjában jelent meg az iskolaújság, a Tiszta Szívvel első száma. Aktív diákélet bontakozott ki, klubok, kirándulások, táborok formájában.
1963
Korszerűsítették az épületet: központi fűtést építettek ki, kezdetben széntüzeléssel, majd földgázzal. A tantermek világítása is elérte a kornak megfelelő szintet. Megújult a tanári szoba és a tantermek bútorzata. Elkészült a diákok bevonásával, társadalmi munkában az új klubterem.
1966
Egy UNESCO pályázat révén dr. Temesi Alfréd a volt francia gyarmatra, Madagaszkárra került a helyi tanárképző főiskola igazgatójának. Megbízott igazgatóként Tardos Ivánné vette át munkáját.
1969
Az évtized végétől lift is üzemel az épületben. A tanárképzés megnövekedett igényei hívták életre a zártláncú televíziós rendszert. Kifejlesztése és megvalósítása Holics László nevéhez fűződik.
A maihoz hasonló tagozatok a hatvanas évek közepétől jelentek meg. 1967-ben végzett az első angol tagozatos osztály. A következő évben biológia-kémia tagozat és két általános tantervű osztály érettségizett. Az általános iskola felső tagozatától indultak nyelvszakos osztályok, a gyakorlóiskolai jellegből fakadóan angol, orosz, német, francia, olasz nyelvet egyaránt lehetett tanulni. Az évtized végén, elsők között, számítástechnikai képzés is folyt, a Nehézipari Minisztériumba járt át egy-egy osztály.
1970
Bucskó Béla 1969/1970-es megbízatása után Fazekas Mihály került az igazgatói székbe az elkövetkező majd két évtizedre (1970-1989).
1971
1971. augusztus 31-én tartották a kollégium avató ünnepséget. Az általános iskolai osztályokat felmenő rendszerben megszüntették, s az első emeleten, valamint a második szint egyik felén száz férőhelyet hoztak létre.
1973
Létrejött a Marx György féle „komplex” tagozat. Ekkortól beszélhetünk fakultatív oktatásról is. A mai fizika termek is ekkor készültek el. Az általános iskola megszűnésével emelkedett a gimnáziumi osztályok száma.
1989
Az egyetem rektora Pfeiffer Ádámot nevezte ki a gimnázium élére. Neki köszönhető a kémia-, biológialaboratóriumok és előadótermek megépítésére.
1991
A gimnázium telket vásárolt Tiszainokán. A gólyatábor Zamárdiba költözött. Elindultak az Apáczai-napok és a különböző tantárgyak Apáczai-versenyei.
A volt tanulóinkból álló Apáczai Baráti Kör Egyesület 1991 februárjában alapítványt hozott létre
Alapítvány az Apáczai Gimnáziumért néven az iskola tanulóinak, nyugdíjas tanárainak támogatása, az informatikai kultúra fejlesztése és az iskola egyéb célkitűzéseinek támogatására. Ettől az évtől lehet az adók egy százalékával támogatni az alapítványt.
1994
Megnyitotta kapuit a tiszainokai tábor. Ősszel elindult az első két hatosztályos osztály. Ugyanekkor indult az első társadalomtudományi tagozat is.
2001
Munkácsy László lett az iskola igazgatója. Az épületben részleges felújítások történtek: tantermek, a könyvtár, a színházterem, a számítógéptermek, az ebédlő és nyelvi termek, melyek Vágó György és Korenchy Lajos nevét viselik. Sor került az irattár rendezésére is.
2004
2004. február 4-én indult el a
Meridián hírportál (kezdetben Meridián Online néven futott, 2009-ben rövidült a neve Meridiánra). A portál célja, hogy friss és naprakész információval szolgáljon az apáczaisoknak.
2010
Az épület akadálymentesítésen esett át.
2023
Az épület harmadik és negyedik emelete szinte teljes felújításon esett át.